中国热带农业科学院热带生物技术研究所（简称“生物所”）成立于2002年。

生物所是隶属于中国热带农业科学院的国家级科研机构，专门从事热带生物技术研究。以重要热带作物和热带特色生物资源为研究对象，围绕种质与基因资源、功能基因与遗传改良、南繁育种与生物安全、热带生物资源次生代谢、微生物工程与农村环境生物治理、甘蔗产业技术和热带海洋生物资源七个领域开展基础研究、应用基础研究和技术创新。

生物所拥有农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室、农业农村部转基因植物及植物用微生物环境安全监督检验测试中心( 海口)、中国科协“海智计划”工作基地和国际香蕉产业科技合作创新院等17个部省级及以上科技平台，1个博士后科研工作站、2个院士创新平台；牵头建设中国热带农业科学院三亚研究院和广西研究院。获省直机关第三批“创建文明单位示范点”命名。

核定人员编制数470人。现有干部职工200人，其中博士106人，高级职称人员112人。133人获海南省高层次人才认定。获得“973”首席科学家、中央直接联系掌握高级专家、国家高层次人才特殊支持计划、国家有突出贡献中青年专家、享受国务院特殊津贴专家、全国优秀科技工作者、全国五一劳动奖章、农业科研杰出人才等国家级、省部级荣誉称号专家50余人次。拥有产业技术体系首席科学家1人，岗位科学家和试验站站长8名。

建所以来，获部省级科技奖励62项，牵头建设国家香蕉产业技术体系，参与国家木薯、糖料和中药材3个产业技术体系建设，在木薯、香蕉、甘蔗、药用植物、微生物、海洋生物资源、南繁育种等领域取得突破性进展，为我国乃至世界热带农业和生物产业发展提供了重要的基础理论和技术支撑。先后承担了“863”计划、“973” 计划、国家自然科学基金、公益性行业科研专项及国际合作专项等国内国际重大项目。在热带作物基因资源研究、木薯基因组分析、香蕉基因组分析、沉香基因组分析、香蕉枯萎病致病机理、木薯抗逆与淀粉高效积累、沉香物质基础及结香机理、甘蔗蔗糖合成与转运、转基因种质创制等领域的研究处于国际领先水平。

“十四五”期间，坚持“四个面向”，紧紧围绕国家热带农业科学中心建设、南繁硅谷建设、乡村振兴战略“三大使命”，做好前沿引领、技术支撑、典型示范“三篇文章”，推进出成果和出人才并举、科学研究和人才培养相结合，加快创建世界一流热带生物工程技术创新中心。