热带生物技术研究所文昌综合试验基地始建于2007年，占地面积380亩，是集科研试验、中试加工、成果转化为一体的“综合试验基地”。基地主要涵盖有热带微生物发酵工程中试平台、海南黎药园、热带水产动物健康养殖实验与示范平台、生物健康饲料研发与应用示范平台、食用菌中试平台、生物肥料和生物制剂研发平台、转基因安全评价中心、木薯杂交育种圃、香蕉诱变种质资源圃。该基地依托国家重点研发项目“热带作物现代育种技术研发”、农业农村部“南海生物资源调查与评估（南锋专项II期）”、海南省重大科技计划项目“火山岩石斛和胆木的产业化关键技术研究与示范”等项目为基础，以“科研+转化”为抓手，重点构建热带微生物发酵工程中试平台“牧草种植——饲料加工——畜牧养殖”、沉香种植示范推广及产品研发平台“沉香良种选育——整树结香——沉香功能性成分研究”、水产健康养殖实验平台“苗种优选——苗种标粗——池塘养殖”三个专业化循环体系。