蛋白质组学技术平台可以开展蛋白提取、蛋白酶解、肽段分离、质谱鉴定、基于免疫共沉淀的互作蛋白质谱鉴定、基于质谱的蛋白质磷酸化修饰位点鉴定、高通量比较蛋白质组学分析、差异蛋白的生物信息学分析等。主要仪器设备有ABSCIEX5800、5600生物质谱仪、GE AKTAAvant 25 蛋白纯化仪器、蛋白互作仪、GE LAS4000mini 蛋白发光检测仪等。