近日，中国热科院生物所联合12家科研单位系统回顾了过去20余年植物分子生物学相关生物软件的发展过程，提出研究人员数据挖掘效率提升是亟需关注的重要问题。以TBtools软件十年发展历程为例，总结了植物分子生物学软件研发经验，凝练面向研究者需求的软件开发原则，并进一步展望未来AI-ready生物软件的发展方向。

在过去二十年中，植物分子生物学领域的一个核心挑战在于：大多数湿实验生物学家有限的数据挖掘能力，与生物数据快速增长和日益多样化之间的差距不断扩大。因此提升植物学家的数据探索效率成为一个亟待解决的问题。本研究总结植物生物学200个常用软件，并基于TBtools十年发展经验（图1）提出面向研究者需求的软件设计原则。总体而言，植物分子生物学研究不仅需要算得快、算得准的软件，也需要用得上、用得好的软件。面向未来，生物软件应更好地整合数据、功能与算力，逐步走向真正AI-ready的软件形态。

图1.TBtools用户群体和引文概况

相关成果以“How to make big data accessible to plant biologists and beyond: Ten years of lessons from TBtools”为题发表于《Molecular Plant》。中国热带农业科学院热带生物技术研究所冯筠庭助理研究员、环境与植物保护研究所吴亚、热带作物品种资源研究所陈程杰研究员为共同第一作者。华南农业大学园艺学院夏瑞教授、中国热带农业科学院热带生物技术研究所谢江辉研究员、热带作物品种资源研究所王家保研究员和陈程杰研究员为共同通讯作者。该研究得到三亚崖州湾科技城项目、国家自然科学基金、中国热带农业科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费等项目资助。

论文链接：https://doi.org/10.1016/j.molp.2026.05.015